第二屆全國人民代表大會第一次會議於1959年4月18日至4月28日在北京舉行，出席代表1226人。會議聽取了國務院總理周恩來所作的《政府工作報告》；分別聽取了國務院副總理兼計劃委員會主任李富春《關於1959年國民經濟計劃草案的報告》、國務院副總理兼財政部長李先念《關於1958年國家決算和1959年國家預算草案的報告》、全國人大常委會副委員長兼秘書長彭真關於《中華人民共和國全國人民代表大會常務委員會工作報告》、第二屆全國人大代表資格審查委員會主任委員馬明方所作的《第二屆全國人民代表大會代表資格審查委員會關於代表資格的審查報告》及預算委員會主任委員曾山《關於1958年國家決算和1959年國家預算草案的審查報告。

　　會議通過了政府工作報告、1959年國民經濟計劃、1958年國家決算和1959年國家預算的決議，通過了全國人大常委會工作報告的決議、《關於西藏問題的決議》和關於撤銷司法部和監察部的決議；通過了提案審查委員會的提案審查意見。

　　會議選舉劉少奇為中華人民共和國主席，宋慶齡、董必武為中華人民共和國副主席，朱德為全國人大常委會委員長；根據劉少奇主席提名，決定周恩來為國務院總理。會議還通過國務院副總理、秘書長、各部部長、各委員會主任的人選；通過了國防委員會副主席、委員的人選；通過了第二屆全國人大民族委員會和法案委員會的主任委員、委員人選。

　　全國人大二屆二次會議

　　第二屆全國人民代表大會第二次會議於1960年3月30日至4月10日在北京舉行，出席代表1072人。會議聽取了國務院副總理兼國家計劃委員會主任李富春作關於1960年國民經濟計劃草案的報告，國務院副總理兼財政部長李先念作關於1959年國家決算和1960年國家預草案的報告。中共中央書記處書記、國務院副總理譚震林向大會作「為提前實現全國農業發展綱要而奮鬥」的報告。國務院總理周恩來就目前國家形勢和中國對外關係問題講了話。

　　會議通過了1960年國民經濟計劃，1959年國家決算和1960年國家預算的決議。決議批准了李富春、李先念兩位副總理向大會作的報告。通過了《1956年到1967年全國農業發展綱要》。會議通過了關於提前實現全國農業發展綱要而奮鬥的決議，決議批准了譚震林副總理向大會作的報告。會議還通過了全國人大常委會工作報告的決議，通過了提案審查委員會的提案審查意見。

　　全國人大二屆三次會議

　　第二屆全國人民代表大會第三次會議於1962年3月27日至4月16日在北京舉行，出席代表1072人。會議聽取了周恩來總理作《政府工作報告》。《政府工作報告》分為國際形勢和我國對外政策和國內形勢和我們的任務兩部分，詳細地闡述了我國對外關係的總路線和各項具體政策。

　　會議通過關於政府工作報告的決議；批准了全國人大常委會的工作報告和預算委員會的審查報告；通過了提案審查委員會的提案審查意見和代表資格審查委員會關於補選的代表資格審查報告。會議期間外交部向大會分發了中國政府和印度政府交換的22件照會及1960年12月中、印兩兩國官員關於邊界問題的報告。

　　全國人大二屆四次會議

　　第二屆全國人民代表大會第四次會議於1963年11月17日至12月3日在北京舉行，出席代表1072人。國務院副總理李富春向大會作了關於1963年國民經濟計劃執行情況和1964年國民經濟計劃草案的報告。國務院副總理李先念作了關於1963年國家預算草案和預算執行情況、1964年國家預算初步安排的報告。國務院總理周恩來就國內外形勢和任務講了話。

　　會議通過了關於1963年國民經濟計劃和1964年國民經濟計劃、1963年國家預算和1964年國家預算初步安排的決議；通過了關於第三屆全國人大代表名額和選舉問題的決議。會議批准了全國人大常委會副委員長兼秘書長彭真作的「關於第三屆全國人大代表名額和選舉問題的說明」。會議通過決議，批准了全國人大常委會工作報告；通過了預算委員會關於國家預算的審查報告，通過了提案審查委員會的提案審查意見。